| 26. Spieltag | 26.03.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | Wacker Burghausen | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 02.04.2016 | Wacker Burghausen | - | Viktoria Aschaffenburg | 0:3 | ||||
| 30. Spieltag | 22.04.2016 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Wacker Burghausen | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 29.04.2016 | Wacker Burghausen | - | FC Augsburg II | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 06.05.2016 | FC Amberg | - | Wacker Burghausen | 0:2 | ||||
| 33. Spieltag | 16.05.2016 | Wacker Burghausen | - | FV Illertissen | 4:1 | ||||
| 34. Spieltag | 21.05.2016 | SpVgg Bayreuth | - | Wacker Burghausen | 3:5 |
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