| 1. Spieltag | 16.07.2013 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 2. Spieltag | 20.07.2013 | FK Tom Tomsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 1:2 | ||||
| 3. Spieltag | 27.07.2013 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 3:0 |  |
|||
| 4. Spieltag | 03.08.2013 | FK Tom Tomsk | - | FK Ural | 1:2 | ||||
| 8. Spieltag | 15.09.2013 | FK Tom Tomsk | - | Anzhi Makhachkala | 2:2 | ||||
| 9. Spieltag | 22.09.2013 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 1:2 | ||||
| 10. Spieltag | 26.09.2013 | FK Tom Tomsk | - | Volga Nizhniy Novgorod | 1:0 |
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