| 4. Spieltag | 11.09.2016 | KF Trepça'89 | - | KF Llapi | 3:0 | ||||
| 7. Spieltag | 28.09.2016 | FK Drenica | - | KF Trepça'89 | 2:3 |  |
|||
| 13. Spieltag | 06.11.2016 | Drita Gjilan | - | KF Trepça'89 | 0:0 | ||||
| 15. Spieltag | 20.11.2016 | KF Llapi | - | KF Trepça'89 | 2:0 | ||||
| 20. Spieltag | 07.03.2017 | KF Trepça'89 | - | KF Prishtina | 1:0 | |
|||
| 21. Spieltag | 12.03.2017 | KF Besa | - | KF Trepça'89 | 2:3 | |
|||
| 22. Spieltag | 19.03.2017 | KF Trepça'89 | - | KF Trepça | 6:1 | |
|||
| 23. Spieltag | 02.04.2017 | KF Trepça'89 | - | KF Liria | 2:0 | |
|||
| 26. Spieltag | 16.04.2017 | Drita Gjilan | - | KF Trepça'89 | 0:2 | |
|||
| 28. Spieltag | 28.04.2017 | KF Hajvalia | - | KF Trepça'89 | 0:3 | |
|||
| 29. Spieltag | 05.05.2017 | KF Trepça'89 | - | KF Gjilani | 5:2 | |
|||
| 30. Spieltag | 09.05.2017 | KF Besa | - | KF Trepça'89 | 0:2 | |
|||
| 31. Spieltag | 14.05.2017 | KF Trepça'89 | - | KF Llapi | 8:1 | |
Nigeria