| 1. Spieltag | 12.03.2000 | FC Aarau | - | FC Zürich | 0:0 | ||||
| 2. Spieltag | 19.03.2000 | FC Sion | - | FC Aarau | 2:0 | ||||
| 3. Spieltag | 26.03.2000 | FC Aarau | - | FC Baden | 2:0 | ||||
| 5. Spieltag | 09.04.2000 | AC Bellinzona | - | FC Aarau | 2:2 | ||||
| 6. Spieltag | 16.04.2000 | FC Aarau | - | FC Thun | 2:0 | ||||
| 7. Spieltag | 20.04.2000 | FC Aarau | - | SR Delémont | 5:2 |  |
|||
| 8. Spieltag | 29.04.2000 | SR Delémont | - | FC Aarau | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 06.05.2000 | FC Thun | - | FC Aarau | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 13.05.2000 | FC Aarau | - | AC Bellinzona | 1:1 | |
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| 11. Spieltag | 20.05.2000 | FC Aarau | - | FC Lugano | 2:2 | |
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| 12. Spieltag | 27.05.2000 | FC Baden | - | FC Aarau | 1:3 | |
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| 13. Spieltag | 04.06.2000 | FC Aarau | - | FC Sion | 3:1 | |
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| 14. Spieltag | 07.06.2000 | FC Zürich | - | FC Aarau | 1:0 |
Bulgarien