| 1. Spieltag | 23.07.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Wil 1900 | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 11.08.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Aarau | 0:0 | ||||
| 5. Spieltag | 20.08.2016 | FC Wil 1900 | - | Servette FC | 2:0 | ||||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | FC Wohlen | - | FC Wil 1900 | 1:3 | ||||
| 7. Spieltag | 12.09.2016 | FC Winterthur | - | FC Wil 1900 | 3:0 | ||||
| 8. Spieltag | 21.09.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Le Mont | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 24.09.2016 | FC Chiasso | - | FC Wil 1900 | 0:4 | ||||
| 10. Spieltag | 03.10.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Schaffhausen | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 16.10.2016 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 0:1 | ||||
| 12. Spieltag | 23.10.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Winterthur | 5:1 | ||||
| 13. Spieltag | 31.10.2016 | Servette FC | - | FC Wil 1900 | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 03.12.2016 | FC Zürich | - | FC Wil 1900 | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 10.12.2016 | FC Wil 1900 | - | Neuchâtel Xamax FCS | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 17.05.2017 | FC Wil 1900 | - | FC Winterthur | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 20.05.2017 | FC Zürich | - | FC Wil 1900 | 0:2 |  |
Schweiz