| 11. Spieltag | 18.01.2017 | AO Chania | - | Aiginiakos FC | 3:2 | ||||
| 12. Spieltag | 22.01.2017 | Kissamikos | - | AO Chania | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 05.02.2017 | Panelefsiniakos Elefsinas | - | AO Chania | 1:3 | ||||
| 18. Spieltag | 26.02.2017 | AO Chania | - | Panegialios FC | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 05.03.2017 | Agrotikos Asteras | - | AO Chania | 2:0 |  |
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| 10. Spieltag | 08.03.2017 | Anagennisi Karditsa | - | AO Chania | 2:0 | |
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| 22. Spieltag | 22.03.2017 | AO Chania | - | OFI Heraklion | 0:2 | ||||
| 24. Spieltag | 02.04.2017 | AO Chania | - | Aris Saloniki | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 12.04.2017 | Sparta FC | - | AO Chania | 3:1 | ||||
| 27. Spieltag | 24.04.2017 | AO Chania | - | Anagennisi Karditsa | 2:1 | |
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| 28. Spieltag | 30.04.2017 | Aiginiakos FC | - | AO Chania | 5:1 | ||||
| 30. Spieltag | 12.05.2017 | AEL Kalloni | - | AO Chania | 0:1 | ||||
| 32. Spieltag | 28.05.2017 | AO Trikala | - | AO Chania | 6:1 | ||||
| 33. Spieltag | 04.06.2017 | Apollon Smyrnis | - | AO Chania | 3:0 | ||||
| 34. Spieltag | 11.06.2017 | AO Chania | - | GS Kallithea | 1:3 |
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