| 17. Spieltag | 27.02.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Locarno | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 07.03.2009 | Servette FC | - | FC Stade Nyonnais | 0:0 |  |
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| 19. Spieltag | 13.03.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC La Chaux-de-Fonds | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 20.03.2009 | FC Gossau | - | FC Stade Nyonnais | 2:3 |  |
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| 16. Spieltag | 29.03.2009 | FC Biel/Bienne | - | FC Stade Nyonnais | 4:2 | ||||
| 21. Spieltag | 02.04.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Wil 1900 | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 11.04.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Stade Nyonnais | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 18.04.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC St. Gallen | 1:4 | |
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| 24. Spieltag | 22.04.2009 | FC Thun | - | FC Stade Nyonnais | 1:1 | |
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| 25. Spieltag | 26.04.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Lausanne-Sport | 0:2 | |
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| 27. Spieltag | 09.05.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Winterthur | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 30.05.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Wohlen | 1:3 |
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