| 1. Spieltag | 18.08.2016 | ACS Poli Timişoara | - | FC Botoşani | 0:5 | ||||
| 5. Spieltag | 22.08.2016 | Gaz Metan Mediaş | - | FC Botoşani | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 11.09.2016 | CSM Politehnica Iași | - | FC Botoşani | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 16.09.2016 | FC Botoşani | - | FC Viitorul Constanța | 1:2 | ||||
| 9. Spieltag | 21.09.2016 | Concordia Chiajna | - | FC Botoşani | 0:2 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2016 | CS Universitatea Craiova | - | FC Botoşani | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 10.12.2016 | FC Botoşani | - | CSM Politehnica Iași | 1:3 |  |
|||
| 21. Spieltag | 19.12.2016 | FC Viitorul Constanța | - | FC Botoşani | 3:1 | ||||
| 25. Spieltag | 26.02.2017 | FC Botoşani | - | Pandurii Târgu Jiu | 3:1 | ||||
| 26. Spieltag | 06.03.2017 | Astra Giurgiu | - | FC Botoşani | 3:0 |
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