| 1. Spieltag | 24.07.2009 | NK Inter Zaprešić | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 15.08.2009 | NK Istra 1961 | - | NK Varteks | 0:1 | ||||
| 5. Spieltag | 22.08.2009 | NK Varteks | - | NK Zagreb | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 13.09.2009 | NK Varteks | - | Hajduk Split | 0:3 | ||||
| 9. Spieltag | 26.09.2009 | NK Varteks | - | NK Karlovac | 0:1 | ||||
| 10. Spieltag | 04.10.2009 | Dinamo Zagreb | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 17.10.2009 | NK Varteks | - | NK Međimurje | 3:0 | ||||
| 12. Spieltag | 24.10.2009 | NK Croatia Sesvete | - | NK Varteks | 2:2 | ||||
| 21. Spieltag | 20.03.2010 | NK Varteks | - | HNK Cibalia | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 27.03.2010 | Hajduk Split | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 03.04.2010 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 5:1 | ||||
| 24. Spieltag | 10.04.2010 | NK Karlovac | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 14.04.2010 | NK Varteks | - | Dinamo Zagreb | 1:2 | ||||
| 26. Spieltag | 17.04.2010 | NK Međimurje | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 24.04.2010 | NK Varteks | - | NK Croatia Sesvete | 4:1 |  |
|||
| 28. Spieltag | 01.05.2010 | NK Osijek | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 08.05.2010 | NK Varteks | - | NK Zadar | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 13.05.2010 | Slaven Belupo | - | NK Varteks | 2:3 |
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