| 1. Spieltag | 08.08.2009 | SC Freiburg II | - | Stuttgarter Kickers | 0:0 | ||||
| 4. Spieltag | 12.08.2009 | Eintracht Frankfurt II | - | SC Freiburg II | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 05.09.2009 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SC Freiburg II | 0:3 | ||||
| 7. Spieltag | 13.09.2009 | SC Freiburg II | - | TSV 1860 München II | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 02.10.2009 | SSV Reutlingen | - | SC Freiburg II | 1:4 | ||||
| 11. Spieltag | 18.10.2009 | SC Freiburg II | - | SSV Ulm 1846 | 3:1 | ||||
| 14. Spieltag | 07.11.2009 | VfR Aalen | - | SC Freiburg II | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 22.11.2009 | SC Freiburg II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:2 | ||||
| 16. Spieltag | 29.11.2009 | SC Freiburg II | - | 1. FC Nürnberg II | 1:4 | ||||
| 19. Spieltag | 11.12.2009 | SC Freiburg II | - | Karlsruher SC II | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 05.05.2010 | SC Freiburg II | - | Eintracht Frankfurt II | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 09.05.2010 | SG Sonnenhof Großaspach | - | SC Freiburg II | 3:2 | ||||
| 31. Spieltag | 12.05.2010 | SC Freiburg II | - | VfR Aalen | 3:1 |  |
|||
| 34. Spieltag | 29.05.2010 | SC Freiburg II | - | SC Pfullendorf | 2:0 |
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