| 1. Spieltag | 26.07.2003 | NK Marsonia | - | NK Varteks | 0:0 |  |
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| 2. Spieltag | 02.08.2003 | NK Varteks | - | HNK Rijeka | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 09.08.2003 | NK Osijek | - | NK Varteks | 3:1 | |
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| 4. Spieltag | 18.08.2003 | NK Varteks | - | Slaven Belupo | 2:0 |  |
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| 5. Spieltag | 23.08.2003 | Hajduk Split | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 6. Spieltag | 31.08.2003 | NK Varteks | - | NK Zagreb | 2:0 | ||||
| 8. Spieltag | 20.09.2003 | NK Varteks | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 27.09.2003 | HNK Cibalia | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 10. Spieltag | 04.10.2003 | NK Zadar | - | NK Varteks | 2:2 | |
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| 12. Spieltag | 25.10.2003 | NK Varteks | - | NK Marsonia | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 02.11.2003 | HNK Rijeka | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 08.11.2003 | NK Varteks | - | NK Osijek | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 28.02.2004 | NK Inter Zaprešić | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 06.03.2004 | NK Varteks | - | HNK Cibalia | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 13.03.2004 | NK Varteks | - | NK Zadar | 3:2 | ||||
| 22. Spieltag | 20.03.2004 | Dinamo Zagreb | - | NK Varteks | 3:0 |
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