| 24. Spieltag | 26.11.2016 | SKA-Khabarovsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 5:0 | ||||
| 26. Spieltag | 12.03.2017 | Sibir Novosibirsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 19.03.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Mordovia Saransk | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 26.03.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Neftekhimik | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 01.04.2017 | Fakel Voronezh | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:2 | ||||
| 30. Spieltag | 08.04.2017 | Sokol Saratov | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 17.04.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Tyumen | 3:1 | ||||
| 33. Spieltag | 23.04.2017 | Enisey Krasnoyarsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:0 | ||||
| 34. Spieltag | 29.04.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Dinamo Moskva | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 06.05.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 10.05.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Zenit St. Petersburg 2 | 3:0 |  |
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| 37. Spieltag | 14.05.2017 | Volgar Astrakhan | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:1 | ||||
| 38. Spieltag | 20.05.2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Spartak Nalchik | 3:1 |
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