| 1. Spieltag | 07.08.2016 | Vardar Skopje | - | KF Shkupi | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 14.08.2016 | Vardar Skopje | - | KF Shkëndija 79 | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 11.09.2016 | Makedonija GP | - | Vardar Skopje | 0:4 | ||||
| 6. Spieltag | 18.09.2016 | Vardar Skopje | - | FK Rabotnički | 1:0 |  |
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| 7. Spieltag | 25.09.2016 | FK Renova | - | Vardar Skopje | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 02.10.2016 | Sileks Kratovo | - | Vardar Skopje | 1:3 | |
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| 11. Spieltag | 23.10.2016 | KF Shkëndija 79 | - | Vardar Skopje | 0:2 | ||||
| 12. Spieltag | 30.10.2016 | Vardar Skopje | - | FK Pobeda Junior | 2:1 |  |
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| 13. Spieltag | 05.11.2016 | FK Bregalnica Štip | - | Vardar Skopje | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 16.11.2016 | Vardar Skopje | - | Makedonija GP | 4:1 | |
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| 15. Spieltag | 20.11.2016 | FK Rabotnički | - | Vardar Skopje | 3:0 | ||||
| 16. Spieltag | 27.11.2016 | Vardar Skopje | - | FK Renova | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 04.12.2016 | Vardar Skopje | - | Sileks Kratovo | 1:1 |
Nordmazedonien