| 20. Spieltag | 31.01.2020 | NK Inter Zaprešić | - | NK Istra 1961 | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 23.02.2020 | NK Istra 1961 | - | Slaven Belupo | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.2020 | HNK Gorica | - | NK Istra 1961 | 3:0 | ||||
| 27. Spieltag | 07.06.2020 | NK Istra 1961 | - | HNK Rijeka | 1:3 | ||||
| 28. Spieltag | 11.06.2020 | NK Istra 1961 | - | Hajduk Split | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 20.06.2020 | NK Varaždin | - | NK Istra 1961 | 3:0 | ||||
| 34. Spieltag | 11.07.2020 | NK Osijek | - | NK Istra 1961 | 2:0 | ||||
| 35. Spieltag | 18.07.2020 | NK Istra 1961 | - | Dinamo Zagreb | 0:0 | ||||
| 36. Spieltag | 25.07.2020 | HNK Rijeka | - | NK Istra 1961 | 4:2 |
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