| 1. Spieltag | 12.08.2012 | Vardar Skopje | - | FK Rabotnički | 3:2 |  |
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| 3. Spieltag | 26.08.2012 | Vardar Skopje | - | FK Teteks | 4:0 | |
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| 4. Spieltag | 29.08.2012 | FK Renova | - | Vardar Skopje | 0:2 | |
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| 5. Spieltag | 02.09.2012 | Vardar Skopje | - | FK Turnovo | 5:1 | |
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| 6. Spieltag | 16.09.2012 | Vardar Skopje | - | FK Drita | 4:0 | |
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| 8. Spieltag | 30.09.2012 | Vardar Skopje | - | FK Pelister | 3:1 | |
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| 12. Spieltag | 31.10.2012 | FK Rabotnički | - | Vardar Skopje | 0:2 | |
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| 18. Spieltag | 09.12.2012 | Vardar Skopje | - | Sileks Kratovo | 5:0 | |
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| 20. Spieltag | 12.03.2013 | Vardar Skopje | - | KF Shkëndija 79 | 6:1 | |
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| 21. Spieltag | 17.03.2013 | Metalurg Skopje | - | Vardar Skopje | 3:2 |  |
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| 26. Spieltag | 21.04.2013 | FK Drita | - | Vardar Skopje | 1:3 | |
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| 28. Spieltag | 07.05.2013 | FK Teteks | - | Vardar Skopje | 0:3 | |
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| 29. Spieltag | 11.05.2013 | Vardar Skopje | - | FK Renova | 3:1 | |
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| 31. Spieltag | 19.05.2013 | Vardar Skopje | - | Napredok Kičevo | 4:0 | |
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| 33. Spieltag | 02.06.2013 | Vardar Skopje | - | FK Turnovo | 5:0 | |
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