| 6. Spieltag | 18.10.2008 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 2:1 |  |
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| 13. Spieltag | 06.12.2008 | OFI Heraklion | - | Aris Saloniki | 0:1 | ||||
| 15. Spieltag | 21.12.2008 | Panthrakikos | - | Aris Saloniki | 0:0 | |
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| 18. Spieltag | 18.01.2009 | Panathinaikos | - | Aris Saloniki | 4:0 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.2009 | Aris Saloniki | - | Thrasyvoulos Fylis | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 05.04.2009 | Aris Saloniki | - | OFI Heraklion | 4:1 | |
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| 29. Spieltag | 12.04.2009 | AEK Athen | - | Aris Saloniki | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 26.04.2009 | Aris Saloniki | - | Panthrakikos | 3:2 | |
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