| 1. Spieltag | 12.07.2013 | HNK Rijeka | - | NK Istra 1961 | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 18.08.2013 | NK Osijek | - | NK Istra 1961 | 1:3 | ||||
| 9. Spieltag | 14.09.2013 | NK Istra 1961 | - | NK Zadar | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 25.10.2013 | NK Istra 1961 | - | Slaven Belupo | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 02.11.2013 | NK Istra 1961 | - | NK Osijek | 1:1 | ||||
| 16. Spieltag | 09.11.2013 | Hajduk Split | - | NK Istra 1961 | 2:0 | ||||
| 17. Spieltag | 06.02.2014 | NK Istra 1961 | - | Dinamo Zagreb | 1:3 | ||||
| 21. Spieltag | 09.02.2014 | Hrvatski Dragovoljac | - | NK Istra 1961 | 1:2 |
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