| 2. Spieltag | 06.08.2017 | FC St. Pauli II | - | Eintracht Norderstedt | 1:1 | ||||
| 8. Spieltag | 17.09.2017 | FC St. Pauli II | - | SV Eutin 08 | 1:0 | ||||
| 11. Spieltag | 20.09.2017 | FC St. Pauli II | - | Hannover 96 II | 0:4 | ||||
| 9. Spieltag | 23.09.2017 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli II | 3:1 |  |
|||
| 10. Spieltag | 01.10.2017 | FC St. Pauli II | - | VfB Lübeck | 2:1 | ||||
| 12. Spieltag | 15.10.2017 | TSV Havelse | - | FC St. Pauli II | 0:4 | ||||
| 15. Spieltag | 05.11.2017 | FC St. Pauli II | - | Schwarz-Weiß Rehden | 2:1 | ||||
| 16. Spieltag | 12.11.2017 | Altona 93 | - | FC St. Pauli II | 1:5 | |
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| 18. Spieltag | 26.11.2017 | Eintracht Norderstedt | - | FC St. Pauli II | 1:3 | |
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| 22. Spieltag | 07.03.2018 | Eintracht Braunschweig II | - | FC St. Pauli II | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 17.03.2018 | FC St. Pauli II | - | Hamburger SV II | 1:1 | |
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| 21. Spieltag | 27.03.2018 | FC St. Pauli II | - | Weiche Flensburg 08 | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 05.05.2018 | Schwarz-Weiß Rehden | - | FC St. Pauli II | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 09.05.2018 | VfV Hildesheim | - | FC St. Pauli II | 0:3 |
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