| 6. Spieltag | 10.09.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 1:0 |  |
|||
| 7. Spieltag | 17.09.2016 | FK Tom Tomsk | - | Arsenal Tula | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 26.09.2016 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 2:1 |  |
|||
| 9. Spieltag | 01.10.2016 | FK Tom Tomsk | - | FK Ural | 1:1 | |
|||
| 10. Spieltag | 16.10.2016 | FK Orenburg | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | |
|||
| 11. Spieltag | 22.10.2016 | FK Tom Tomsk | - | Anzhi Makhachkala | 0:3 | |
|||
| 13. Spieltag | 05.11.2016 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Moskva | 0:1 |
Bosnien-Herzegowina
Serbien