| 1. Runde | 07.08.2003 | Cienciano | - | Alianza Lima | 1:0 | ||||
| 1. Runde | 26.08.2003 | Alianza Lima | - | Cienciano | 0:1 | ||||
| Achtelfinale | 25.09.2003 | Cienciano | - | Universidad Católica | 4:0 | ||||
| Achtelfinale | 02.10.2003 | Universidad Católica | - | Cienciano | 3:1 | ||||
| Viertelfinale | 16.10.2003 | Santos FC | - | Cienciano | 1:1 |  |
|||
| Viertelfinale | 29.10.2003 | Cienciano | - | Santos FC | 2:1 | ||||
| Halbfinale | 13.11.2003 | Atlético Nacional | - | Cienciano | 1:2 | ||||
| Halbfinale | 04.12.2003 | Cienciano | - | Atlético Nacional | 1:0 | ||||
| Finale | 10.12.2003 | River Plate | - | Cienciano | 3:3 | ||||
| Finale | 19.12.2003 | Cienciano | - | River Plate | 1:0 | |
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