| 1. Spieltag | 19.07.2013 | FK Dukla Praha | - | 1. SC Znojmo | 1:1 |  |
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| 2. Spieltag | 26.07.2013 | 1. SC Znojmo | - | FK Teplice | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 02.08.2013 | Vysočina Jihlava | - | 1. SC Znojmo | 4:0 | ||||
| 5. Spieltag | 17.08.2013 | FK Baumit Jablonec | - | 1. SC Znojmo | 5:5 |  |
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| 7. Spieltag | 01.09.2013 | Bohemians Praha 1905 | - | 1. SC Znojmo | 2:0 | ||||
| 8. Spieltag | 16.09.2013 | 1. SC Znojmo | - | AC Sparta Praha | 0:2 | ||||
| 9. Spieltag | 22.09.2013 | Zbrojovka Brno | - | 1. SC Znojmo | 2:0 | ||||
| 10. Spieltag | 28.09.2013 | 1. SC Znojmo | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 | |
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| 11. Spieltag | 19.10.2013 | Baník Ostrava | - | 1. SC Znojmo | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 26.10.2013 | 1. SC Znojmo | - | 1. FK Příbram | 3:0 | ||||
| 13. Spieltag | 02.11.2013 | Slovan Liberec | - | 1. SC Znojmo | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 09.11.2013 | 1. SC Znojmo | - | 1. FC Slovácko | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 24.11.2013 | 1. SC Znojmo | - | Sigma Olomouc | 2:1 | |
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| 16. Spieltag | 29.11.2013 | FK Teplice | - | 1. SC Znojmo | 1:3 | |
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