| 1. Spieltag | 23.08.1998 | Ionikos Nikea | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 2. Spieltag | 30.08.1998 | PAOK Saloniki | - | Aris Saloniki | 1:4 | ||||
| 3. Spieltag | 13.09.1998 | AO Kavala | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 20.09.1998 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| 5. Spieltag | 27.09.1998 | Ethnikos Piraeus | - | PAOK Saloniki | 1:1 |  |
|||
| 6. Spieltag | 04.10.1998 | PAOK Saloniki | - | Iraklis Saloniki | 2:1 | ||||
| 10. Spieltag | 22.11.1998 | Apollon Smyrnis | - | PAOK Saloniki | 1:4 | |
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| 11. Spieltag | 29.11.1998 | PAOK Saloniki | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 3:1 | ||||
| 12. Spieltag | 05.12.1998 | Veria FC | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 13.12.1998 | PAOK Saloniki | - | OFI Heraklion | 3:1 | ||||
| 14. Spieltag | 20.12.1998 | Paniliakos Pyrgos | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 16.01.1999 | PAOK Saloniki | - | AO Proodeftiki | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 23.01.1999 | Ethnikos Asteras | - | PAOK Saloniki | 1:0 |
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