| 14. Spieltag | 19.07.2008 | FK Tom Tomsk | - | FK Khimki | 3:1 | ||||
| 15. Spieltag | 25.07.2008 | FK Khimki | - | Spartak Nalchik | 2:0 |  |
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| 17. Spieltag | 09.08.2008 | Spartak Moskva | - | FK Khimki | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 17.08.2008 | FK Khimki | - | FK Moskva | 0:2 | ||||
| 19. Spieltag | 23.08.2008 | Rubin Kazan | - | FK Khimki | 2:0 | |
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| 20. Spieltag | 29.08.2008 | FK Khimki | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 14.09.2008 | Krylia Sovetov | - | FK Khimki | 3:0 | ||||
| 22. Spieltag | 20.09.2008 | FK Khimki | - | FK Saturn | 2:1 |
Moldau