| 29. Spieltag | 04.02.2017 | Leyton Orient | - | Carlisle United | 1:2 | ||||
| 27. Spieltag | 07.02.2017 | Leyton Orient | - | Morecambe FC | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 11.02.2017 | Yeovil Town | - | Leyton Orient | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 14.02.2017 | Plymouth Argyle | - | Leyton Orient | 2:3 | ||||
| 32. Spieltag | 18.02.2017 | Leyton Orient | - | Notts County | 2:3 | ||||
| 33. Spieltag | 25.02.2017 | Leyton Orient | - | Cheltenham Town | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 28.02.2017 | Stevenage FC | - | Leyton Orient | 4:1 | ||||
| 39. Spieltag | 25.03.2017 | Crawley Town | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 40. Spieltag | 01.04.2017 | Leyton Orient | - | Wycombe Wanderers | 0:2 | ||||
| 41. Spieltag | 08.04.2017 | Cambridge United | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 42. Spieltag | 14.04.2017 | Luton Town | - | Leyton Orient | 2:2 |  |
|||
| 43. Spieltag | 17.04.2017 | Leyton Orient | - | Hartlepool United | 2:1 | ||||
| 44. Spieltag | 22.04.2017 | Crewe Alexandra | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 45. Spieltag | 29.04.2017 | Leyton Orient | - | Colchester United | 1:3 | ||||
| 46. Spieltag | 06.05.2017 | Blackpool FC | - | Leyton Orient | 3:1 |
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