| 9. Spieltag | 24.09.2006 | FC Thun | - | FC Luzern | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 03.10.2006 | FC Thun | - | FC Aarau | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 15.10.2006 | BSC Young Boys | - | FC Thun | 5:0 | ||||
| 12. Spieltag | 21.10.2006 | FC Thun | - | Grasshopper Club Zürich | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 05.11.2006 | FC Thun | - | FC Basel 1893 | 1:1 |  |
|||
| 13. Spieltag | 08.11.2006 | FC Schaffhausen | - | FC Thun | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 26.11.2006 | FC Sion | - | FC Thun | 3:0 | |
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