| 12. Spieltag | 20.10.2012 | VfB Oldenburg | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 8. Spieltag | 25.10.2012 | Hannover 96 II | - | Werder Bremen II | 3:2 | ||||
| 13. Spieltag | 28.10.2012 | Hannover 96 II | - | SV Wilhelmshaven | 2:0 | ||||
| 14. Spieltag | 03.11.2012 | Schwarz-Weiß Rehden | - | Hannover 96 II | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 11.11.2012 | Hannover 96 II | - | FC St. Pauli II | 7:0 | ||||
| 17. Spieltag | 24.11.2012 | Hannover 96 II | - | VfL Wolfsburg II | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 01.12.2012 | Hannover 96 II | - | Goslarer SC | 3:2 | ||||
| 20. Spieltag | 02.02.2013 | Hannover 96 II | - | SV Meppen | 1:4 | ||||
| 24. Spieltag | 02.03.2013 | Hannover 96 II | - | ETSV Weiche Flensburg | 2:2 | ||||
| 22. Spieltag | 06.03.2013 | Hannover 96 II | - | Hamburger SV II | 4:0 | ||||
| 26. Spieltag | 16.03.2013 | TSV Havelse | - | Hannover 96 II | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 26.03.2013 | FC Oberneuland | - | Hannover 96 II | annull. | ||||
| 25. Spieltag | 02.04.2013 | Werder Bremen II | - | Hannover 96 II | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 14.04.2013 | Hannover 96 II | - | VfB Oldenburg | 3:0 | ||||
| 31. Spieltag | 27.04.2013 | Hannover 96 II | - | Schwarz-Weiß Rehden | 0:1 |
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