| 1. Spieltag | 30.07.2016 | FC Fastav Zlín | - | 1. FK Příbram | 2:0 |  |
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| 2. Spieltag | 08.08.2016 | Slavia Praha | - | FC Fastav Zlín | 2:2 | ||||
| 3. Spieltag | 13.08.2016 | FC Fastav Zlín | - | Slovan Liberec | 2:1 | |
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| 4. Spieltag | 20.08.2016 | Viktoria Plzeň | - | FC Fastav Zlín | 0:2 | ||||
| 5. Spieltag | 29.08.2016 | FC Fastav Zlín | - | MFK Karviná | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 09.09.2016 | 1. FC Slovácko | - | FC Fastav Zlín | 1:3 |  |
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| 8. Spieltag | 24.09.2016 | FC Hradec Králové | - | FC Fastav Zlín | 0:2 | ||||
| 9. Spieltag | 01.10.2016 | FC Fastav Zlín | - | FK Jablonec | 2:2 | ||||
| 10. Spieltag | 15.10.2016 | FK Teplice | - | FC Fastav Zlín | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 21.10.2016 | FC Fastav Zlín | - | Bohemians Praha 1905 | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 29.10.2016 | FK Mladá Boleslav | - | FC Fastav Zlín | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 05.11.2016 | FC Fastav Zlín | - | Zbrojovka Brno | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 18.11.2016 | Vysočina Jihlava | - | FC Fastav Zlín | 1:3 | ||||
| 15. Spieltag | 26.11.2016 | FC Fastav Zlín | - | FK Dukla Praha | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 02.12.2016 | FC Fastav Zlín | - | Slavia Praha | 0:4 |
Tschechien