| 21. Spieltag | 23.02.2013 | NK Osijek | - | NK Istra 1961 | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 03.03.2013 | NK Istra 1961 | - | HNK Rijeka | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 09.03.2013 | Hajduk Split | - | NK Istra 1961 | 1:2 |  |
|||
| 25. Spieltag | 29.03.2013 | NK Osijek | - | NK Istra 1961 | 0:4 | ||||
| 26. Spieltag | 06.04.2013 | NK Zadar | - | NK Istra 1961 | 3:2 | ||||
| 27. Spieltag | 13.04.2013 | NK Istra 1961 | - | NK Zagreb | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 19.04.2013 | NK Inter Zaprešić | - | NK Istra 1961 | 0:2 | ||||
| 29. Spieltag | 27.04.2013 | NK Istra 1961 | - | HNK Cibalia | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 04.05.2013 | Slaven Belupo | - | NK Istra 1961 | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 10.05.2013 | NK Istra 1961 | - | HNK Rijeka | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 18.05.2013 | RNK Split | - | NK Istra 1961 | 0:1 | ||||
| 33. Spieltag | 26.05.2013 | NK Istra 1961 | - | Lokomotiva Zagreb | 1:1 |
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