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| 26.08.2006 | Vyzas FC | - | Nafpaktiakos Asteras | 5:4 i.E. | ||
| Olympiakos Volou | - | GS Ilioupolis | 1:0 | |||
| Atsalenios | - | Doxa Dramas FC | 3:0 | |||
| Eolikos | - | AS Rhodos | 5:4 i.E. | |||
| Anagennisi Arta | - | AO Kavala | 3:2 n.V. | |||
| Apollon Smyrnis | - | Polykastro FC | 2:1 | |||
| AO Trikala | - | AO Thiva | 1:3 | |||
| Doxa Gratini | - | Pierikos Katerini | 1:4 | |||
| Thyella Patros | - | Anagennisi Karditsa | 3:0 | |||
| Acharnaikos FC | - | PAE Agios Dimitrios | 1:0 | |||
| AE Giannena | - | Panachaiki GE | 1:0 | |||
| PAONE | - | Lamia | 3:0 | |||
| Panetolikos | - | Odysseas Androutsos | 2:0 | |||
| Koropi FC | - | Thermaikos FC | 0:1 | |||
| Diagoras FC | - | PAE Thraki Alexandroupoli | 4:3 | |||
| Paniliakos Pyrgos | - | Ethnikos Katerini | 1:0 |
