| 15. Spieltag | 07.07.1999 | FK Saturn | - | Torpedo Moskva | 2:2 | ||||
| 16. Spieltag | 14.07.1999 | FK Saturn | - | Chernomorets Novorossisk | 3:0 |  |
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| 17. Spieltag | 21.07.1999 | Zhemchuzhina Sochi | - | FK Saturn | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 28.07.1999 | FK Saturn | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 04.08.1999 | Dinamo Moskva | - | FK Saturn | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 14.08.1999 | FK Saturn | - | Krylia Sovetov | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 21.08.1999 | Alania Vladikavkaz | - | FK Saturn | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 28.08.1999 | FK Saturn | - | Uralan Elista | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 11.09.1999 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Saturn | 0:0 |  |
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| 24. Spieltag | 18.09.1999 | FK Saturn | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 | |
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| 26. Spieltag | 02.10.1999 | FK Saturn | - | CSKA Moskva | 2:3 | ||||
| 27. Spieltag | 16.10.1999 | Rotor Volgograd (1929-2005) | - | FK Saturn | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 23.10.1999 | FK Saturn | - | Rostselmash Rostov | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 30.10.1999 | Torpedo Moskva | - | FK Saturn | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 08.11.1999 | FK Saturn | - | Lok. Nizhni Novgorod | 1:1 | |
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