| 2. Spieltag | 24.08.2008 | RAEC Mons | - | KRC Genk | 3:1 | ||||
| 3. Spieltag | 30.08.2008 | KRC Genk | - | Sporting Lokeren | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 14.09.2008 | SV Zulte Waregem | - | KRC Genk | 1:3 | ||||
| 5. Spieltag | 21.09.2008 | KRC Genk | - | Club Brugge KV | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 28.09.2008 | Excelsior Mouscron | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| 7. Spieltag | 04.10.2008 | KRC Genk | - | KV Mechelen | 2:1 |  |
|||
| 8. Spieltag | 18.10.2008 | FCV Dender EH | - | KRC Genk | 2:4 | ||||
| 9. Spieltag | 26.10.2008 | KRC Genk | - | Standard Liège | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 18.01.2009 | Germinal Beerschot | - | KRC Genk | 4:1 | |
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| 19. Spieltag | 24.01.2009 | KRC Genk | - | RAEC Mons | 2:0 | ||||
| 20. Spieltag | 01.02.2009 | Sporting Lokeren | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 07.02.2009 | KRC Genk | - | SV Zulte Waregem | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 15.02.2009 | Club Brugge KV | - | KRC Genk | 0:2 | ||||
| 23. Spieltag | 20.02.2009 | KRC Genk | - | Excelsior Mouscron | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 04.04.2009 | KRC Genk | - | KVC Westerlo | 1:4 |
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