| 12. Spieltag | 24.10.2009 | NK Istra 1961 | - | HNK Šibenik | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 28.11.2009 | HNK Šibenik | - | NK Croatia Sesvete | 2:0 | ||||
| 17. Spieltag | 05.12.2009 | NK Osijek | - | HNK Šibenik | 3:0 | ||||
| 18. Spieltag | 27.02.2010 | HNK Šibenik | - | NK Zadar | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 06.03.2010 | Slaven Belupo | - | HNK Šibenik | 2:2 | ||||
| 20. Spieltag | 13.03.2010 | HNK Šibenik | - | NK Inter Zaprešić | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 27.03.2010 | HNK Šibenik | - | Lokomotiva Zagreb | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 03.04.2010 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 5:1 | ||||
| 24. Spieltag | 10.04.2010 | HNK Šibenik | - | NK Zagreb | 3:1 | ||||
| 25. Spieltag | 14.04.2010 | HNK Cibalia | - | HNK Šibenik | 4:3 | ||||
| 26. Spieltag | 17.04.2010 | HNK Šibenik | - | Hajduk Split | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 24.04.2010 | HNK Šibenik | - | NK Istra 1961 | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 01.05.2010 | NK Karlovac | - | HNK Šibenik | 0:2 | ||||
| 29. Spieltag | 08.05.2010 | HNK Šibenik | - | Dinamo Zagreb | 2:1 |  |
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