| 1. Spieltag | 02.03.2013 | FC Levadia | - | JK Tammeka | 3:1 |  |
|||
| 3. Spieltag | 16.03.2013 | FC Levadia | - | JK Narva Trans | 3:0 | |
|||
| 6. Spieltag | 13.04.2013 | FC Flora | - | FC Levadia | 0:3 | |
|||
| 7. Spieltag | 20.04.2013 | FC Levadia | - | FC Infonet | 2:1 | |
|||
| 19. Spieltag | 19.07.2013 | FC Levadia | - | FC Kuressaare | 2:1 | |
|||
| 20. Spieltag | 29.07.2013 | Paide Linnameeskond | - | FC Levadia | 1:3 | |
|||
| 27. Spieltag | 14.09.2013 | FC Levadia | - | JK Tammeka | 2:0 | |
|||
| 29. Spieltag | 21.09.2013 | FC Levadia | - | JK Tallinna Kalev | 5:0 | |
Estland