| 11. Spieltag | 16.07.2006 | FK Saturn | - | Spartak Nalchik | 1:4 | ||||
| 12. Spieltag | 21.07.2006 | Spartak Moskva | - | FK Saturn | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 30.07.2006 | FK Saturn | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 05.08.2006 | Rubin Kazan | - | FK Saturn | 0:3 |  |
|||
| 20. Spieltag | 24.09.2006 | FK Saturn | - | FK Tom Tomsk | 2:1 |  |
|||
| 21. Spieltag | 01.10.2006 | FK Saturn | - | CSKA Moskva | 2:2 |  |
|||
| 22. Spieltag | 14.10.2006 | FK Amkar Perm | - | FK Saturn | 1:0 | |
|||
| 23. Spieltag | 21.10.2006 | FK Saturn | - | FK Rostov | 0:0 | |
|||
| 24. Spieltag | 25.10.2006 | Krylia Sovetov | - | FK Saturn | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 29.10.2006 | FK Saturn | - | Luch-Energiya Vladivostok | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 05.11.2006 | Spartak Nalchik | - | FK Saturn | 2:0 | |
|||
| 29. Spieltag | 18.11.2006 | FK Saturn | - | Rubin Kazan | 1:2 |
Slowakei