| 1. Spieltag | 14.03.2009 | Dinamo Moskva | - | FK Moskva | 1:0 | ||||
| 2. Spieltag | 21.03.2009 | FK Moskva | - | Terek Grozny | 0:0 |  |
|||
| 3. Spieltag | 04.04.2009 | Rubin Kazan | - | FK Moskva | 0:0 | ||||
| 5. Spieltag | 18.04.2009 | FK Saturn | - | FK Moskva | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 26.04.2009 | FK Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 02.05.2009 | FK Amkar Perm | - | FK Moskva | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 10.05.2009 | FK Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 16.05.2009 | FK Khimki | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 24.05.2009 | FK Moskva | - | FK Rostov | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 30.05.2009 | Krylia Sovetov | - | FK Moskva | 1:1 | |
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| 12. Spieltag | 14.06.2009 | FK Moskva | - | CSKA Moskva | 2:0 |  |
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| 13. Spieltag | 12.07.2009 | Zenit St. Petersburg | - | FK Moskva | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 19.07.2009 | FK Moskva | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 4:1 | |
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| 15. Spieltag | 26.07.2009 | Spartak Nalchik | - | FK Moskva | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 25.10.2009 | CSKA Moskva | - | FK Moskva | 1:3 | ||||
| 27. Spieltag | 31.10.2009 | FK Moskva | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 |
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