| 1. Spieltag | 01.08.2016 | Rubin Kazan | - | FK Amkar Perm | 0:0 |  |
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| 2. Spieltag | 07.08.2016 | FK Amkar Perm | - | Anzhi Makhachkala | 2:0 |  |
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| 3. Spieltag | 15.08.2016 | FK Orenburg | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 4. Spieltag | 21.08.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Ural | 1:0 | ||||
| 5. Spieltag | 27.08.2016 | Zenit St. Petersburg | - | FK Amkar Perm | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 10.09.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 15.10.2016 | FK Amkar Perm | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 20.11.2016 | Spartak Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 05.12.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Orenburg | 3:0 | ||||
| 19. Spieltag | 12.03.2017 | FK Amkar Perm | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 |
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