| 5. Spieltag | 09.09.2006 | SC Freiburg II | - | SSV Ulm 1846 | 3:1 | ||||
| 6. Spieltag | 16.09.2006 | Waldhof Mannheim | - | SC Freiburg II | 3:0 | ||||
| 7. Spieltag | 24.09.2006 | SV Sandhausen | - | SC Freiburg II | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 30.09.2006 | SC Freiburg II | - | FC 08 Villingen | 2:3 |  |
|||
| 15. Spieltag | 18.11.2006 | Heidenheimer SB 1846 | - | SC Freiburg II | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 09.12.2006 | SG Sonnenhof Großaspach | - | SC Freiburg II | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 05.05.2007 | SC Freiburg II | - | TSG Hoffenheim II | 2:2 | ||||
| 31. Spieltag | 12.05.2007 | VfR Mannheim | - | SC Freiburg II | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 19.05.2007 | SC Freiburg II | - | Heidenheimer SB 1846 | 3:1 |  |
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