| 12. Spieltag | 29.09.2024 | Arsenal Tula | - | FK Ufa | 0:0 | ||||
| 13. Spieltag | 05.10.2024 | FK Ufa | - | SKA-Khabarovsk | 3:3 | ||||
| 14. Spieltag | 12.10.2024 | FK Ufa | - | Chernomorets Novorossisk | 0:3 | ||||
| 15. Spieltag | 20.10.2024 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Ufa | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 27.10.2024 | FK Ufa | - | Rotor Volgograd | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 10.11.2024 | SKA-Khabarovsk | - | FK Ufa | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 16.11.2024 | FK Ufa | - | Sokol Saratov | 2:0 | ||||
| 20. Spieltag | 22.11.2024 | FK Sochi | - | FK Ufa | 5:2 | ||||
| 21. Spieltag | 30.11.2024 | Chernomorets Novorossisk | - | FK Ufa | 2:1 |  |
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| 23. Spieltag | 09.03.2025 | Torpedo Moskva | - | FK Ufa | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 15.03.2025 | FK Ufa | - | Enisey Krasnoyarsk | 0:1 | ||||
| 25. Spieltag | 23.03.2025 | FK Ufa | - | Baltika Kaliningrad | 0:6 | ||||
| 26. Spieltag | 29.03.2025 | FK Kamaz | - | FK Ufa | 1:0 | |
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| 28. Spieltag | 12.04.2025 | FK Ufa | - | Alania Vladikavkaz | 2:1 | ||||
| 29. Spieltag | 20.04.2025 | Rodina Moskva | - | FK Ufa | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 27.04.2025 | FK Ufa | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 04.05.2025 | FK Ufa | - | FK Neftekhimik | 1:0 |
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