| 5. Spieltag | 30.08.2013 | FC Istres | - | AJ Auxerre | 1:1 | ||||
| 8. Spieltag | 24.09.2013 | AJ Auxerre | - | CA Bastia | 1:0 | ||||
| 9. Spieltag | 27.09.2013 | Dijon FCO | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 04.10.2013 | AJ Auxerre | - | Stade Lavallois | 2:0 | ||||
| 13. Spieltag | 01.11.2013 | AJ Auxerre | - | Tours FC | 4:0 |  |
|||
| 14. Spieltag | 08.11.2013 | Clermont Foot 63 | - | AJ Auxerre | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 21.02.2014 | AJ Auxerre | - | Angers SCO | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 14.03.2014 | Stade Lavallois | - | AJ Auxerre | 3:0 | ||||
| 29. Spieltag | 21.03.2014 | US Créteil-Lusitanos | - | AJ Auxerre | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 28.03.2014 | AJ Auxerre | - | ESTAC Troyes | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 04.04.2014 | Tours FC | - | AJ Auxerre | 2:2 | ||||
| 32. Spieltag | 11.04.2014 | AJ Auxerre | - | Clermont Foot 63 | 0:2 | ||||
| 33. Spieltag | 19.04.2014 | SM Caen | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 02.05.2014 | Chamois Niortais | - | AJ Auxerre | 1:0 | |
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| 36. Spieltag | 06.05.2014 | AJ Auxerre | - | Havre AC | 2:1 |
Gabun