| 6. Spieltag | 13.04.2013 | FC Flora | - | FC Levadia | 0:3 |  |
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| 8. Spieltag | 27.04.2013 | Paide Linnameeskond | - | FC Levadia | 3:4 | |
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| 25. Spieltag | 24.08.2013 | FC Levadia | - | JK Narva Trans | 2:1 | |
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| 30. Spieltag | 28.09.2013 | JK Narva Trans | - | FC Levadia | 0:2 | |
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| 32. Spieltag | 05.10.2013 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Levadia | 1:2 | |
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| 34. Spieltag | 26.10.2013 | FC Infonet | - | FC Levadia | 0:3 | |
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| 36. Spieltag | 09.11.2013 | FC Kuressaare | - | FC Levadia | 2:4 | |
Estland