| 1. Spieltag | 15.07.2016 | Slaven Belupo | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 |  |
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| 2. Spieltag | 23.07.2016 | NK Inter Zaprešić | - | NK Osijek | 0:2 | ||||
| 3. Spieltag | 30.07.2016 | HNK Cibalia | - | NK Inter Zaprešić | 3:3 | ||||
| 4. Spieltag | 07.08.2016 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Rijeka | 1:1 | |
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| 5. Spieltag | 13.08.2016 | Dinamo Zagreb | - | NK Inter Zaprešić | 2:1 | ||||
| 6. Spieltag | 21.08.2016 | NK Inter Zaprešić | - | Lokomotiva Zagreb | 2:1 | |
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| 9. Spieltag | 17.09.2016 | NK Istra 1961 | - | NK Inter Zaprešić | 4:1 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2016 | NK Inter Zaprešić | - | Slaven Belupo | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 01.10.2016 | NK Osijek | - | NK Inter Zaprešić | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 23.10.2016 | HNK Rijeka | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 29.10.2016 | NK Inter Zaprešić | - | Dinamo Zagreb | 0:1 | ||||
| 17. Spieltag | 27.11.2016 | Hajduk Split | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 | |
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| 18. Spieltag | 05.12.2016 | NK Inter Zaprešić | - | NK Istra 1961 | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 09.12.2016 | Slaven Belupo | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 |
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