| 5. Spieltag | 06.04.2024 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 4:3 | ||||
| 7. Spieltag | 21.04.2024 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 2:2 | ||||
| 21. Spieltag | 01.05.2024 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 9. Spieltag | 05.05.2024 | FC Flora | - | FCI Levadia | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 11.05.2024 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 0:1 | ||||
| 17. Spieltag | 29.06.2024 | Nõmme United | - | FC Flora | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 04.07.2024 | FCI Levadia | - | FC Flora | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 19.07.2024 | JK Tammeka | - | FC Flora | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 03.08.2024 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 18.08.2024 | FC Flora | - | Nõmme United | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 23.08.2024 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 0:1 | ||||
| 26. Spieltag | 30.08.2024 | FC Flora | - | FCI Levadia | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 20.10.2024 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 2:1 | ||||
| 35. Spieltag | 03.11.2024 | FCI Levadia | - | FC Flora | 4:2 |  |
|||
| 36. Spieltag | 09.11.2024 | FC Flora | - | JK Tallinna Kalev | 5:1 |
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