| 1. Runde | 02.07.2013 | Metalurg Skopje | - | Qarabağ FK | 0:1 | ||||
| 1. Runde | 11.07.2013 | Qarabağ FK | - | Metalurg Skopje | 1:0 | ||||
| 2. Runde | 18.07.2013 | Qarabağ FK | - | Piast Gliwice | 2:1 | ||||
| 2. Runde | 25.07.2013 | Piast Gliwice | - | Qarabağ FK | 2:2 n.V. | ||||
| 3. Runde | 01.08.2013 | Qarabağ FK | - | Gefle IF | 1:0 | ||||
| 3. Runde | 08.08.2013 | Gefle IF | - | Qarabağ FK | 0:2 | ||||
| Playoffs | 22.08.2013 | Qarabağ FK | - | Eintracht Frankfurt | 0:2 | ||||
| Playoffs | 29.08.2013 | Eintracht Frankfurt | - | Qarabağ FK | 2:1 |  |
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