| 2. Spieltag | 27.08.2016 | FC Jumilla | - | Extremadura UD | 2:0 |  |
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| 5. Spieltag | 18.09.2016 | Extremadura UD | - | Linares Deportivo | 1:2 | ||||
| 6. Spieltag | 25.09.2016 | Córdoba CF B | - | Extremadura UD | 0:0 | ||||
| 12. Spieltag | 02.11.2016 | UD Melilla | - | Extremadura UD | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 06.11.2016 | Extremadura UD | - | Granada CF B | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 13.11.2016 | San Fernando CD | - | Extremadura UD | 1:3 | ||||
| 16. Spieltag | 27.11.2016 | Marbella FC | - | Extremadura UD | 3:2 | ||||
| 17. Spieltag | 04.12.2016 | Extremadura UD | - | Real Jaén | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 11.12.2016 | Atlético Sanluqueño CF | - | Extremadura UD | 3:0 | |
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| 19. Spieltag | 18.12.2016 | Extremadura UD | - | Real Murcia | 0:2 | ||||
| 20. Spieltag | 08.01.2017 | CF Villanovense | - | Extremadura UD | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 22.01.2017 | RB Linense | - | Extremadura UD | 1:0 |
Spanien