| 1. Spieltag | 14.03.2009 | Lokomotiv Moskva | - | FK Khimki | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 22.03.2009 | FK Rostov | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 05.04.2009 | Lokomotiv Moskva | - | Krylia Sovetov | 2:1 | ||||
| 4. Spieltag | 12.04.2009 | CSKA Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 4:1 | ||||
| 5. Spieltag | 19.04.2009 | Lokomotiv Moskva | - | Zenit St. Petersburg | 1:1 |  |
|||
| 6. Spieltag | 26.04.2009 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Lokomotiv Moskva | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 03.05.2009 | Lokomotiv Moskva | - | Spartak Nalchik | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 10.05.2009 | FK Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 16.05.2009 | Lokomotiv Moskva | - | Terek Grozny | 4:0 | ||||
| 10. Spieltag | 23.05.2009 | Rubin Kazan | - | Lokomotiv Moskva | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 30.05.2009 | Lokomotiv Moskva | - | Spartak Moskva | 2:1 | ||||
| 12. Spieltag | 14.06.2009 | FK Saturn | - | Lokomotiv Moskva | 2:0 | ||||
| 14. Spieltag | 19.07.2009 | FK Amkar Perm | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 |
Tschechien