| Gruppe B | 20.09.2012 | Viktoria Plzeň | - | Académica de Coimbra | 3:1 |  |
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| Gruppe B | 04.10.2012 | Atlético Madrid | - | Viktoria Plzeň | 1:0 | ||||
| Gruppe B | 25.10.2012 | Hapoel Tel Aviv | - | Viktoria Plzeň | 1:2 | ||||
| Gruppe B | 08.11.2012 | Viktoria Plzeň | - | Hapoel Tel Aviv | 4:0 | ||||
| Gruppe B | 22.11.2012 | Académica de Coimbra | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| Gruppe B | 06.12.2012 | Viktoria Plzeň | - | Atlético Madrid | 1:0 | ||||
| Achtelfinale | 07.03.2013 | Viktoria Plzeň | - | Fenerbahçe | 0:1 | ||||
| Achtelfinale | 14.03.2013 | Fenerbahçe | - | Viktoria Plzeň | 1:1 |
Tschechien