| 4. Spieltag | 07.02.2009 | Club San Luis | - | Atlas Guadalajara | 2:1 | ||||
| 5. Spieltag | 15.02.2009 | Atlas Guadalajara | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 19.02.2009 | CF América | - | Atlas Guadalajara | 2:2 | ||||
| 7. Spieltag | 22.02.2009 | Atlas Guadalajara | - | Pumas UNAM | 2:0 |  |
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| 13. Spieltag | 12.04.2009 | Atlas Guadalajara | - | Club Necaxa | 4:1 | ||||
| 15. Spieltag | 26.04.2009 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Toluca | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 03.05.2009 | Monarcas Morelia | - | Atlas Guadalajara | 4:2 |
Mexiko