| 5. Spieltag | 26.09.2016 | AEK Athen | - | AEP Iraklis FC | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 16.10.2016 | PAOK Saloniki | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 23.10.2016 | AEP Iraklis FC | - | Atromitos | 1:2 |  |
|||
| 10. Spieltag | 07.11.2016 | AEP Iraklis FC | - | Platanias Chanion | 1:1 | |
|||
| 12. Spieltag | 27.11.2016 | Levadiakos | - | AEP Iraklis FC | 3:0 | ||||
| 13. Spieltag | 05.12.2016 | AEP Iraklis FC | - | PAS Giannina | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 11.12.2016 | Panetolikos | - | AEP Iraklis FC | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 18.12.2016 | AEP Iraklis FC | - | Asteras Tripolis | 1:1 | ||||
| 1. Spieltag | 03.01.2017 | AEP Iraklis FC | - | Xanthi FC | 0:1 | ||||
| 21. Spieltag | 19.02.2017 | Panionios GSS | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 26.02.2017 | AEP Iraklis FC | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 02.04.2017 | AO Kerkyra | - | AEP Iraklis FC | 0:3 | ||||
| 30. Spieltag | 30.04.2017 | Asteras Tripolis | - | AEP Iraklis FC | 2:2 |  |
|
Griechenland