| 1. Spieltag | 01.03.2024 | FC Flora | - | Nõmme United | 2:0 | ||||
| 5. Spieltag | 06.04.2024 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 4:3 |  |
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| 6. Spieltag | 14.04.2024 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 19. Spieltag | 17.04.2024 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 1:3 | ||||
| 7. Spieltag | 21.04.2024 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 2:2 | ||||
| 21. Spieltag | 01.05.2024 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 10. Spieltag | 11.05.2024 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 18.05.2024 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 12. Spieltag | 21.05.2024 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 29.05.2024 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 2:3 | |
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| 14. Spieltag | 01.06.2024 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 2:0 | ||||
| 16. Spieltag | 19.06.2024 | FC Flora | - | JK Tammeka | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 29.06.2024 | Nõmme United | - | FC Flora | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 04.07.2024 | FCI Levadia | - | FC Flora | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 19.07.2024 | JK Tammeka | - | FC Flora | 2:0 |
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