| 2. Spieltag | 12.09.2016 | FK Kukësi | - | KF Teuta Durrës | 3:0 | ||||
| 4. Spieltag | 24.09.2016 | KF Laçi | - | FK Kukësi | 0:0 | ||||
| 5. Spieltag | 01.10.2016 | FK Kukësi | - | FK Partizani | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 12.10.2016 | Flamurtari Vlorë | - | FK Kukësi | 1:1 | ||||
| 7. Spieltag | 16.10.2016 | FK Kukësi | - | KS Korabi Peshkopi | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 21.11.2016 | KF Teuta Durrës | - | FK Kukësi | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 30.11.2016 | FK Kukësi | - | KF Laçi | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 10.12.2016 | FK Kukësi | - | Flamurtari Vlorë | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 14.12.2016 | KS Korabi Peshkopi | - | FK Kukësi | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 27.01.2017 | FK Vllaznia | - | FK Kukësi | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 23.04.2017 | FK Kukësi | - | KF Tiranë | 4:1 | ||||
| 34. Spieltag | 15.05.2017 | KS Korabi Peshkopi | - | FK Kukësi | 1:3 |
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